Selangkah Lagi Mengenali Karakteristik SARS-CoV-2 di Indonesia

- Editor

Selasa, 5 Mei 2020

facebook twitter whatsapp telegram line copy

URL berhasil dicopy

facebook icon twitter icon whatsapp icon telegram icon line icon copy

URL berhasil dicopy

Indonesia selangkah lagi bisa mengenali karakteristik virus korona baru SARS-CoV-2 pemicu Covid-19 yang beredar di Indonesia. Hal itu seiring dengan keberhasilan Lembaga EIjkman mengurutkan keseluruhan genom virus itu.

KOMPAS/ABDULLAH FIKRI ASHRI—Petugas mengecek sampel di Laboratorium Fakultas Kedokteran Universitas Swadaya Gunung Jati (UGJ) di Cirebon, Jawa Barat, Senin (5/4/2020). Laboratorium tersebut segera menjadi tempat pengujian Covid-19 di Cirebon dan sekitarnya. Dalam sehari, laboratorium tersebut dapat memeriksa 100 – 150 sampel. Dengan begitu, deteksi virus korona jenis baru penyebab Covid-19 dapat segera dilakukan.

Lembaga Biologi Molekuler Eijkman berhasil mengurutkan keseluruhan genom SARS-CoV-2 di Indonesia. Data genom ini dibutuhkan untuk mengetahui karakteristik dan galur virus korona baru penyebab Covid-19 yang beredar di Indonesia, selain juga diperlukan untuk pengembangan vaksin.

ADVERTISEMENT

SCROLL TO RESUME CONTENT

Data urutan keseluruhan genom (full genome) SARS-CoV-2 dari tiga isolat dari pasien di Indonesia telah didaftarkan Eijkman di platform Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID), situs daring yang menjadi wadah bagi para ilmuwan di seluruh dunia menyimpan dan berbagi informasi tentang virus yang tengah mewabah.

“Ini untuk pertama genom total SARS-CoV-2 di Indonesia yang panjangnya 29.000 basa didaftarkan di GISAID. Sebelumnya, Litbang (Badan Penelitian dan Pengembangan) Kesehatan Kementerian Kesehatan pernah mendaftarkan juga, namun bukan full genome dengan panjang urutan hanya di kisaran 400 – 600 basa saja,” kata Hidayat Trimarsanto, peneliti di Lembaga Biologi Molekuler Eijkman, di Jakarta, Senin (4/5/2020).

Menurut Hidayat, tiga genom SARS-CoV-2 ini berasal dari spesimen yang diambil selama bulan Maret 2020. “Kami masih menyiapkan empat isolat lagi untuk didaftarkan di GISAID. Kalau semuanya sudah di-submit, baru akan kami analisis lebih jauh,” kata dia.

Virus di Indonesia ini belum diketahui genotipenya, karena GISAID masih belum memasukkan data tersebut dalam sistem analisa global mereka. Sejauh ini, GISAID telah mengumpulkan 16.000 data genom SARS-CoV-2 dari berbagai negara di dunia. Hampir semua negara lain di Asia, termasuk Malaysia, Vietnam, Kamboja dan Filipina, telah lebih dulu mendaftarkan datanya dan telah dianalisa kekerabatannya.

“Tetapi kemungkinannya isolat yang kami kirim ini masih dekat dengan strain Wuhan, berhubung ini temasuk sampel awal,” kata Hidayat.

Wakil Kepala Lembaga Eijkman Herawati Supolo Sudoyo mengatakan, data tentang genetik virus SARS-CoV-2 yang beredar di Indonesia ini sangat penting untuk kepentingan studi epidemiologi lebih lanjut. Data ini bisa dipakai untuk mengevaluasi tes diagnostik, melacak kasus, dan mengidentifikasi opsi intervensi potensial untuk menekan penyebaran, hingga pengemabngan obat-obatan. “Data ini jadi dasar bagi pengembangan vaksin di Indonesia,” tuturnya.

Untuk mendukung hal tersebut, menurut dia, Eijkman menargetkan untuk mengurutkan genom dari 100 spesimen SARS-CoV-2 yang adan di Indonesia. “Tetapi ini tergantung dari dananya juga. Sejauh ini sudah ada donasi dari swasta untuk mengurutkan 25 spesimen,” kata Herawati.

Terus bermutasi
Ketua Perhimpunan Dokter Paru Indonesia Agus Dwi Susanto mengatakan, informasi mengenai genom virus pemicu Covid-19 di Indonesia sangat penting untuk mengetahui karakternya. “Ada dugaan tipe virus korona yang lebih mematikan dibandingkan yang lainnya. Kita perlu tahu, tipe yang mana di Indonesia,” ungkapnya.

Seperti diketahui, SARS-CoV-2 yang merupakan virus RNA ini terus bermutasi. Mengacu pada data di GISAID, ada empat kelompok besar dari SARS-CoV-2, yaitu S, G, V, dan O.

KOMPAS/JUMARTO YULIANUS–Petugas menyemprot boks berisi spesimen swab dengan cairan disinfektan saat baru tiba di Balai Besar Teknik Kesehatan Lingkungan dan Pengendalian Penyakit (BBTKLPP), Banjarbaru, Kalimantan Selatan, Senin (4/5/2020). Spesimen swab dari Kalimantan Selatan dan Kalimantan Tengah diperiksa di laboratorium BBTKLPP Banjarbaru untuk mengonfirmasi kasus Covid-19. Pemeriksaan spesimen swab di laboratorium BBTKLPP Banjarbaru dilakukan sejak 4 April 2020. Jumlah spesimen yang telah diperiksa mencapai 1.298 spesimen.

Sementara penelitian yang dilakukan Li Lanjuan dan tim dari Universitas Zhejiang di Hangzhou, Cina dan diterbitkan dalam makalah non-peer-review di situs medRxiv.org menyebutkan, virus ini telah bermutasi menjadi lebih dari 30 karakter yang berbeda.

Penelitian ini juga menemukan bahwa jenis yang berbeda dapat menghasilkan tingkat viral load atau banyaknya virus yang sangat berbeda dengan yang lain. Hal ini membuat satu strain jauh lebih berbahaya dibandingkan lainnya.

Satu strain, misalnya, bisa menghasilkan 270 kali viral load, yang berarti orang yang terinfeksi menghasilkan 270 kali lebih banyak virus dibandingkan strain yang paling tidak kuat.

Berdasarkan data ini, Li mengajukan menjelaskan mengapa beberapa kasus Covid-19 secara signifikan lebih buruk daripada yang lain. Li mengisolasi strain yang berbeda dan mengukur seberapa cepat dan efektif mereka dapat menginfeksi dan membunuh sel inang.

Makalah ini juga melacak berbagai jenis wabah di berbagai belahan dunia, menemukan bahwa versi SARS-CoV-2 yang menyebar ke seluruh Eropa dan New York adalah pembunuh yang jauh lebih efisien daripada yang menyerang bagian lain AS seperti Washington. Li juga menyarankan, pengembangan obat-obatan dan vaksin, perlu memperhitungkan berbagai strain virus ini.

Oleh AHMAD ARIF

Editor EVY RACHMAWATI

Sumber: Kompas, 5 Mei 2020

Yuk kasih komentar pakai facebook mu yang keren

Informasi terkait

Metode Sainte Lague, Cara Hitung Kursi Pileg Pemilu 2024 dan Ilustrasinya
Jack Ma Ditendang dari Perusahaannya Sendiri
PT INKA Fokus pada Kereta Api Teknologi Smart Green, Mesin Bertenaga Air Hidrogen
7 Sesar Aktif di Jawa Barat: Nama, Lokasi, dan Sejarah Kegempaannya
Anak Non SMA Jangan Kecil Hati, Ini 7 Jalur Masuk UGM Khusus Lulusan SMK
Red Walet Majukan Aeromodelling dan Dunia Kedirgantaraan Indonesia
Penerima Nobel Fisika sepanjang waktu
Madura di Mata Guru Besar UTM Profesor Khoirul Rosyadi, Perubahan Sosial Lunturkan Kebudayaan Taretan Dibi’
Berita ini 0 kali dibaca

Informasi terkait

Rabu, 21 Februari 2024 - 07:30 WIB

Metode Sainte Lague, Cara Hitung Kursi Pileg Pemilu 2024 dan Ilustrasinya

Rabu, 7 Februari 2024 - 14:23 WIB

Jack Ma Ditendang dari Perusahaannya Sendiri

Rabu, 7 Februari 2024 - 14:17 WIB

PT INKA Fokus pada Kereta Api Teknologi Smart Green, Mesin Bertenaga Air Hidrogen

Rabu, 7 Februari 2024 - 14:09 WIB

7 Sesar Aktif di Jawa Barat: Nama, Lokasi, dan Sejarah Kegempaannya

Rabu, 7 Februari 2024 - 13:56 WIB

Anak Non SMA Jangan Kecil Hati, Ini 7 Jalur Masuk UGM Khusus Lulusan SMK

Minggu, 24 Desember 2023 - 15:27 WIB

Penerima Nobel Fisika sepanjang waktu

Selasa, 21 November 2023 - 07:52 WIB

Madura di Mata Guru Besar UTM Profesor Khoirul Rosyadi, Perubahan Sosial Lunturkan Kebudayaan Taretan Dibi’

Senin, 13 November 2023 - 13:59 WIB

Meneladani Prof. Dr. Bambang Hariyadi, Guru Besar UTM, Asal Pamekasan, dalam Memperjuangkan Pendidikan

Berita Terbaru

US-POLITICS-TRUMP

Berita

Jack Ma Ditendang dari Perusahaannya Sendiri

Rabu, 7 Feb 2024 - 14:23 WIB